CHROMATOGRAPHIE EN PHASE LIQUIDE COUPLEE AVEC LA SPECTROMETRIE DE MASSE HAUTE RESOLUTION (LC-HRMS) – ACQUISITION ET TRAITEMENT DES DONNEES OMICS DEDIEES AUX PETITES MOLECULES

A – Introduction sur le couplage LC-MS

Brefs rappels sur la chromatographie en phase liquide haute performance (HPLC)

• Optimisation et conditions standards de séparation

Spectrométrie de masse : principes fondamentaux nécessaires à la réalisation d’un couplage 

• Généralités
• Sources : sélection de tampons, optimisation phase mobile, adduits
• Analyseurs : résolution, mesure de masse exacte, mode d’acquisition, paramètres de détection
• Calibration

B – Différentes approches en HRMS

Ciblé, suspect, non-ciblé

Critères de spécificité, d’identification

Prétraitement des données en non ciblé

• Calibration, extraction de l’information, filtration des données, alignement de spectres et chromatogrammes

C – Traitement des données : outils disponibles et critères de choix

Outils chimiométriques

Stratégies d’annotation de composés

Bases de données