Sciences analytiques

CHROMATOGRAPHIE LIQUIDE COUPLEE AVEC LA SPECTROMETRIE DE MASSE APPLIQUEE AUX PROTEINES

Durée 2 jours 14 heures
Sessions
  • 5 et 6 octobre 2017
Lieu Lyon

Frais d’inscription
(déjeuner inclus)

1 525 € HT

Public concerné

Ingénieurs
Techniciens supérieurs

Objectifs

Acquérir et approfondir les connaissances théoriques et pratiques des couplages de chromatographie en phase liquide et spectrométrie de masse appliqués aux biomolécules.

Contenu pédagogique

THEORIE

Chromatographie en phase liquide

Brève révision des principes généraux de la chromatographie en phase liquide
Appareillages

Spectrométrie de masse : principes fondamentaux nécessaires à la réalisation d’un couplage

Description générale d’un spectromètre de masse :
– Les différents modes d’ionisation et de source (Electrospray, MALDI)
– Les analyseurs (Triple quadripôle, ToF, QqToF, QTrap, Orbitrap)
Notion de masse, motif isotopique et résolution
Mesure de masses de peptides et protéines en MS
Spectrométrie de masse en tandem (Fragmentation des peptides et des protéines, modes d’activation)

Couplage LC-MS et LC-MS/MS

Présentation des différentes configurations d’appareillages
Conditions particulières liées à l’analyse de peptides et protéines

Applications du couplage LC-MS à l’étude des protéines

Notions de base sur les protéines et peptides
Traitement des échantillons protéiques
Exemples d’identification, de quantification et de caractérisation (modifications post-traductionnelles)
Traitement de données d’acquisition

Travaux pratiques en laboratoire

Analyse d’échantillons protéiques par couplage LC-MS/MS
Préparation de l’échantillon
Choix des paramètres à optimiser (conditions chromatographiques, conditions d’ionisation, paramètres d’acquisition) :
– Traitement de données MS
– Interprétation spectrale
Identification des protéines (choix de la base de données…) :
– Pertinence des résultats
Exemples d’application : répertoire de protéines d’un échantillon complexe, étude de modifications post-traductionnelles de protéines, quantification relative aux protéines

Coordonnées

CPE Lyon Formation Continue

Campus Saint-Paul – Bâtiment F 10, Place des Archives – 69002 LYON

04.72.32.50.60